Distribution and characterization of sugar cane yellows Phytoplasma in Mauritius
| MSI02P3743 | |
| Parmessur, Y. Aljanabi, S. Saumtally, S. Jones, P. | |
| (Distribution et caractérisation du phytoplasme, agent causal de la maladie feuille jaune de la canne à sucre à Maurice) | |
| Distribution and characterization of sugar cane yellows Phytoplasma in Mauritius | |
| Periodical article | |
| 2001/02 | |
| Revue agric. sucr. Ile Maurice | |
| 80(3)/81(1-3): 179-184 | |
| Published 2003 | |
| En | |
| To better understand the nature of recent outbreaks of yellow leaf syndrome (YLS) of sugar cane in Mauritius, a study was carried out to assess the distribution and genetic diversity of Sugar cane yellows phytoplasma (SCYP), one of the pathogens associated with the disease. A total of 150 varieties with or without YLS symptoms obtained from quarantine, a variety collection plot and commercial fields were examined. A 1.25 kb DNA fragment encoding for the phytoplasma 16S rRNA operon was amplified by nested-PCR in 85 (57 percent) varieties, showing the wide distribution of SCYP in Mauritius. Restriction fragment length polymorphism analysis of the amplified PCR products after digestion with RsaI and comparison with five specific phytoplasma groups revealed the existence of three groups of the pathogen amongst the isolates tested as well as the occurrence of a mixed group. Cloning of the PCR products of three samples followed by RFLP analysis demonstrated that two strains of the phytoplasma or the existence of two 16S rRNA operons within the same phytoplasma could occur within the same plant. In addition to base substitution, DNA sequencing showed variation in size of the different fragments. [FRENCH: Afin de mieux comprendre la nature des récentes épidémies causées par le syndrome de la feuille jaune (YLS) de la canne à sucre à Maurice, une étude a été entreprise pour déterminer la distribution et la diversité génétique du phytoplasme nommé Sugarcane yellows phytoplasma (SCYP), un des deux pathogènes associés à cette maladie. Cent cinquante variétés avec ou sans symptômes, provenant de la quarantaine, d'une collection variétale et des champs commerciaux, ont été examinées. Un fragment de 1.25 kb codant pour le 16S ARNr du phytoplasme a été amplifié par la technique PCR dans 85 (57 percent) variétés, indiquant la large distribution du phytoplasme à Maurice. L'analyse du produit PCR par RFLP après digestion avec l'enzyme RsaI et comparaison avec cinq groupes spécifiques de phytoplasmes a révélé l'existence de trois groupes de cet organisme parmi les isolats testés, ainsi qu'un groupe mixte. Le clonage du produit PCR de trois échantillons, suivi d'une analyse RFLP a démontré que soit deux types du phytoplasme ou la présence de deux opérons 16SARNr dans un même phytoplasme pourraient exister dans la même plante] | |
| SUGARCANE diseases sugar cane yellow leaf virus yellow leaf syndrome PCR genetic diversity | |
| MAURITIUS | |
| Sugarcane | |
| Diseases | |
| 2002-10-07 | |
| En | |
| Mauritius Sugar Industry Research Institute | |
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